MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome II

Total Repeats: 35851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021821	CGA	2	6	182	187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021821	TTG	2	6	261	266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021821	CAC	2	6	469	474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_021821	GCG	2	6	565	570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021821	CGA	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021821	TTG	2	6	870	875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021821	CAC	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021821	GAT	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021821	CG	3	6	1297	1302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021821	GTG	2	6	1347	1352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021821	ATA	2	6	1353	1358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021821	T	6	6	1385	1390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021821	ACGTT	2	10	1402	1411	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021821	AAC	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021821	CTG	2	6	1438	1443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021821	TCA	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021821	ACC	2	6	1457	1462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021821	CCT	2	6	1479	1484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021821	TCT	2	6	1566	1571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021821	AAC	2	6	1680	1685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021821	GAA	2	6	1698	1703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021821	TAT	2	6	1762	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021821	TTA	2	6	1776	1781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021821	A	7	7	1781	1787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021821	AGT	3	9	1819	1827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021821	TCA	2	6	1878	1883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021821	GT	3	6	1886	1891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021821	CTTTT	2	10	1961	1970	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021821	CTT	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021821	TTAT	2	8	1995	2002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021821	GAA	2	6	2018	2023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021821	ACC	2	6	2030	2035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_021821	ACA	2	6	2065	2070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021821	TAA	2	6	2087	2092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021821	ACC	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_021821	CAGCA	2	10	2117	2126	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_021821	TTTTG	2	10	2171	2180	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021821	TTA	2	6	2190	2195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021821	T	6	6	2217	2222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021821	TTTA	2	8	2228	2235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021821	ATT	3	9	2237	2245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021821	AAC	2	6	2275	2280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021821	TAGC	2	8	2323	2330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021821	ATT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525848541
45	NC_021821	GAA	2	6	2471	2476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848541
46	NC_021821	TCT	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848541
47	NC_021821	CCA	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848541
48	NC_021821	CAA	2	6	2550	2555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848541
49	NC_021821	CT	3	6	2566	2571	0 %	50 %	0 %	50 %	525848541
50	NC_021821	TGA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848541
51	NC_021821	A	6	6	2628	2633	100 %	0 %	0 %	0 %	525848541
52	NC_021821	AAT	2	6	2646	2651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848541
53	NC_021821	ATC	2	6	2655	2660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848541
54	NC_021821	ATTT	2	8	2688	2695	25 %	75 %	0 %	0 %	525848541
55	NC_021821	GAA	2	6	2702	2707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848541
56	NC_021821	TTTA	2	8	2730	2737	25 %	75 %	0 %	0 %	525848541
57	NC_021821	ACA	2	6	2750	2755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848541
58	NC_021821	TCA	2	6	2756	2761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848541
59	NC_021821	CAAA	2	8	2802	2809	75 %	0 %	0 %	25 %	525848542
60	NC_021821	GAC	2	6	2835	2840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848542
61	NC_021821	TTTC	2	8	2850	2857	0 %	75 %	0 %	25 %	525848542
62	NC_021821	AT	3	6	2864	2869	50 %	50 %	0 %	0 %	525848542
63	NC_021821	CAA	2	6	2898	2903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848542
64	NC_021821	T	6	6	2913	2918	0 %	100 %	0 %	0 %	525848542
65	NC_021821	GAAT	2	8	2939	2946	50 %	25 %	25 %	0 %	525848542
66	NC_021821	TG	3	6	3017	3022	0 %	50 %	50 %	0 %	525848542
67	NC_021821	CATA	2	8	3095	3102	50 %	25 %	0 %	25 %	525848542
68	NC_021821	TCA	2	6	3200	3205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848542
69	NC_021821	CAA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848542
70	NC_021821	TTG	2	6	3239	3244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848542
71	NC_021821	GAA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848543
72	NC_021821	AAC	2	6	3519	3524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848543
73	NC_021821	TCT	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848543
74	NC_021821	CTT	2	6	3727	3732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847174
75	NC_021821	CT	4	8	3733	3740	0 %	50 %	0 %	50 %	525847174
76	NC_021821	CAT	2	6	3741	3746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847174
77	NC_021821	TCT	2	6	3892	3897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847174
78	NC_021821	CAT	2	6	3957	3962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847174
79	NC_021821	GCT	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847174
80	NC_021821	CTG	2	6	4054	4059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847174
81	NC_021821	T	7	7	4078	4084	0 %	100 %	0 %	0 %	525847174
82	NC_021821	TCT	3	9	4157	4165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847174
83	NC_021821	TAA	2	6	4246	4251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021821	TA	3	6	4258	4263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021821	GCT	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847175
86	NC_021821	TTCC	2	8	4424	4431	0 %	50 %	0 %	50 %	525847175
87	NC_021821	CTT	2	6	4445	4450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847175
88	NC_021821	TAA	2	6	4457	4462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525847175
89	NC_021821	CCA	2	6	4478	4483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847175
90	NC_021821	TTTG	2	8	4645	4652	0 %	75 %	25 %	0 %	525847175
91	NC_021821	TGA	2	6	4665	4670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847175
92	NC_021821	GCG	2	6	4740	4745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525847175
93	NC_021821	ATC	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847175
94	NC_021821	TCA	2	6	4789	4794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847175
95	NC_021821	CGA	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847175
96	NC_021821	GCTC	2	8	4865	4872	0 %	25 %	25 %	50 %	525847175
97	NC_021821	CGC	2	6	4880	4885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525847175
98	NC_021821	ACG	2	6	4904	4909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847175
99	NC_021821	TTG	2	6	4917	4922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847175
100	NC_021821	TTG	2	6	4926	4931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847175
101	NC_021821	CTT	2	6	4967	4972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847175
102	NC_021821	TGA	2	6	5047	5052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847176
103	NC_021821	GGT	2	6	5073	5078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525847176
104	NC_021821	GTTT	2	8	5083	5090	0 %	75 %	25 %	0 %	525847176
105	NC_021821	TGCT	2	8	5128	5135	0 %	50 %	25 %	25 %	525847176
106	NC_021821	CAT	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847176
107	NC_021821	TTGC	2	8	5184	5191	0 %	50 %	25 %	25 %	525847176
108	NC_021821	AGCT	2	8	5274	5281	25 %	25 %	25 %	25 %	525847176
109	NC_021821	TATTT	2	10	5329	5338	20 %	80 %	0 %	0 %	525847176
110	NC_021821	TTC	2	6	5357	5362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847176
111	NC_021821	TTG	2	6	5366	5371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847176
112	NC_021821	AGA	2	6	5389	5394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525847176
113	NC_021821	GC	3	6	5448	5453	0 %	0 %	50 %	50 %	525847176
114	NC_021821	GCT	2	6	5462	5467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847176
115	NC_021821	TCA	2	6	5585	5590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847176
116	NC_021821	CAG	2	6	5595	5600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847176
117	NC_021821	TCA	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847176
118	NC_021821	ACC	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847176
119	NC_021821	CGA	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847176
120	NC_021821	CTT	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847176
121	NC_021821	TTC	2	6	5770	5775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847176
122	NC_021821	TTTGGA	2	12	5820	5831	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525847176
123	NC_021821	T	6	6	5839	5844	0 %	100 %	0 %	0 %	525847176
124	NC_021821	AAC	2	6	5965	5970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847176
125	NC_021821	CAC	2	6	5973	5978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847176
126	NC_021821	TTC	2	6	6019	6024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847176
127	NC_021821	GAT	2	6	6071	6076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847176
128	NC_021821	TA	3	6	6092	6097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021821	TCA	2	6	6199	6204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021821	TTG	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021821	T	6	6	6274	6279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021821	ATT	2	6	6312	6317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021821	A	6	6	6318	6323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021821	ACC	2	6	6348	6353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_021821	ATT	2	6	6450	6455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021821	CTT	2	6	6456	6461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021821	CAA	2	6	6494	6499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021821	TCAA	2	8	6523	6530	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021821	TAT	2	6	6623	6628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021821	GATTT	2	10	6656	6665	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021821	ACCA	2	8	6729	6736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021821	GTT	2	6	6748	6753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021821	ATT	2	6	6816	6821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021821	TCTT	2	8	6868	6875	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021821	ATA	2	6	6946	6951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021821	ATCA	2	8	6993	7000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_021821	TCC	2	6	7032	7037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_021821	TCT	2	6	7057	7062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_021821	CT	3	6	7153	7158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021821	ATC	2	6	7170	7175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_021821	AT	3	6	7202	7207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021821	TAAG	2	8	7239	7246	50 %	25 %	25 %	0 %	525847177
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185	NC_021821	TTTCA	2	10	8547	8556	20 %	60 %	0 %	20 %	525847179
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266	NC_021821	TACT	2	8	12887	12894	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
267	NC_021821	TC	3	6	12917	12922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
268	NC_021821	T	7	7	12964	12970	0 %	100 %	0 %	0 %	525847181
269	NC_021821	CTA	2	6	12975	12980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847181
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